基于電子捕獲裂解 / 電子轉運裂解串聯(lián)質譜技術的蛋白質組學研究 *
孫瑞祥 1)** 董夢秋 2)** 遲 浩 1) 楊 兵 2) 秀麗蘊 1) 王樂珩 1) 付 巖 1) 賀思敏 1)
( 1) 中國科學院計算技術研究所,智能信息處理重點實驗室,北京 100190; 2) 北京生命科學研究所,北京 102206)
[摘要]
蛋白質組學的興起帶動了質譜技術的快速發(fā)展,而質譜技術的進步則拓寬了蛋白質組學研究問題的廣度. 最近 10 年內,肽段或完整蛋白質在質譜儀中的裂解技術———電子捕獲裂解(electron capture dissociation, ECD)與電子轉運裂解(electrontransfer dissociation, ETD)逐漸發(fā)展起來. ECD 和 ETD 在蛋白質組學中的應用,特別是在蛋白質的翻譯后修飾鑒定和“自頂而下(Top-down)”的完整蛋白質裂解研究中已經展示出了誘人的前景. 對 ECD 和 ETD 的基本原理、質譜特點、儀器實現(xiàn)、數(shù)據解析算法與軟件開發(fā),以及在蛋白質組學中的應用進展等方面進行了比較系統(tǒng)全面的闡述,并對當前的研究問題、面臨的技術挑戰(zhàn)與未來的發(fā)展趨勢等方面作了深入剖析.
關鍵詞 電子捕獲裂解,電子轉運裂解,碰撞誘導裂解,串聯(lián)質譜技術,計算蛋白質組學
生物化學與生物物理進展
Progress in Biochemistry and Biophysics
2010, 37(1): 94~102 新技術講座