島津MALDI-TOF微生物鑒定系統(tǒng)探索地下水質量和菌群之間的聯(lián)系
發(fā)布時間:2021-01-22 閱讀次數(shù)：950次
地下水中的細菌群落非常重要，因為它們保持了平衡的生物地球化學環(huán)境。研究當遭受壓力環(huán)境（例如，由于人為污染）時，細菌群落及其動態(tài)變化。通過面對環(huán)境變化的地下水微生物組的反應，可以增加我們對微生物生態(tài)學不斷增長的了解，并將其用于新型生物修復策略的發(fā)展。
采用高通量且更簡單的技術來實時研究不同的微生物群落及其動力學是必要的，尤其是在檢查較大的數(shù)據集時。MALDI-TOF是用于高通量鑒定細菌的主要工具。美國德克薩斯大學阿靈頓分?；瘜W與生物化學系、環(huán)境分析與修復合作實驗室附屬機構，以及圣安東尼奧市和休斯敦UTHealth公共衛(wèi)生學院基于島津微生物鑒定平臺iDplus Cofidence共同研究探索了油氣開采活動與附近地下水細菌群落之間的聯(lián)系。
MALDI-TOF鑒定受污染地下水中的細菌種類
從德克薩斯州弗里奧縣Eagle Ford頁巖地區(qū)的水樣中發(fā)現(xiàn)的細菌種類的總菌落形成單位（CFU）。并顯示了附近活動的常規(guī)生產井（綠點）和非常規(guī)生產井（紫色點）的位置。
熱圖：顯示德克薩斯州弗里奧縣的19個地下水樣品中的不同細菌種類。熱圖上的數(shù)字表示CFU。
在這項工作中，從德克薩斯州南部地區(qū)收集了地下水樣品，其中農業(yè)活動和非常規(guī)油氣開發(fā)是最普遍的人為活動。使用MALDI-TOF MS對細菌群落進行了評估，并根據多種有機和無機地下水成分對細菌的多樣性和豐度進行了分析，主要分離了Phylum變形桿菌的反硝化細菌和異養(yǎng)細菌，這些微生物能夠將硝酸鹽轉化為氣態(tài)形式的氮或降解有機化合物，例如碳氫化合物?？傮w而言，從所收集的地下水樣品中觀察到的組成差異，細菌群落差異很大。這些數(shù)據為位于人為地表和地下活動附近的地下水中細菌多樣性提供了基線測量。
參考文獻：
Science of the Total Environment 618 (2018) 165–173